Em Setembro de 2012 Matheus assina contrato com o Bahia e faz uma grande temporada , em 28 jogos marca 14 gols.
Conquista um 3º lugar na Copa do Brasil Sub-20(2012) e faz uma bela Copa SP(2013) , ficando em 3º lugar e sendo um dos artilheiros do time.
Esse grande desempenho em pouco tempo de clube o levou a subir para o profissional.
Vídeo com belos gols e grandes jogadas pelo Bahia:
www.youtube.com/watch?v=whgkV07hNU0&feature=share
Reportagens sobre Matheus: